La fondation du village remonte à 1822 et la paroisse, elle, à 1833. Dissous en 1847, le village est rétabli en 1855. Alfred Bessette, qui allait devenir le célèbre frère André (1845-1937) de l’oratoire Saint-Joseph, a vécu à Saint-Césaire de 1854 à 1860. Le village obtient le statut de ville en 1962.